FC Hlučín và Opava

Coufal là sản phẩm của đội trẻ Baník Ostrava nhưng không có cơ hội thi đấu cho đội này do bị đánh giá là thấp bé và yếu sức[2], nên anh khởi đầu thi đấu chuyên nghiệp ở một đội bóng hạng nhì là Hlučín[3] vào tháng 9 năm 2010.

Kết thúc mùa giải 2010-11, Hlučín rớt hạng xuống MSFL với vị trí đứng cuối bảng. Tuy nhiên Coufal vẫn tiếp tục thi đấu ở giải hạng nhì Séc khi được đem cho mượn tại Opava.

Slovan Liberec

Sau nửa năm thi đấu cho Opava, Coufal chuyển đến Slovan Liberec thi đấu tại Giải bóng đá vô địch quốc gia Séc từ năm 2012.[2][4]

Coufal có sáu mùa bóng tại Slovan Liberec và cùng đội bóng này giành chức vô địch Cúp bóng đá Séc mùa bóng 2014-15.

SK Slavia Prague

Mùa hè năm 2018, Coufal chuyển đến Slavia Prague.[4] Anh cùng Slavia Prague giành hai chức vô địch quốc gia Séc trong hai mùa bóng thi đấu tại đây.[5]

West Ham United

Ngày 2 tháng 10 năm 2020, Coufal đến Anh thi đấu cho West Ham United với phí chuyển nhượng 5,4 triệu £ cùng bản hợp đồng có thời hạn ba năm. Tại đây, anh được tái ngộ với người đồng hương Cộng hòa Séc cũng là đồng đội cũ tại Slavia Prague là Tomáš Souček.[6] Chỉ hai ngày sau khi đến nước Anh, Coufal được đá chính trong trận đấu với Leicester City và West Ham đã giành chiến thắng 3-0.[7] Đến ngày 24 tháng 10, anh có pha kiến tạo đầu tiên cho West Ham với đường chuyền cho Michail Antonio mở tỉ số trong trận hòa 1-1 với Manchester City.[8]

Kết thúc mùa giải 2020-21, West Ham chỉ để thủng lưới 47 bàn so với 62 bàn mùa giải trước và kết thúc trong top 6 Ngoại hạng Anh. Coufal là một trong những mắt xích đáng tin cậy nhất hàng thủ West Ham và còn đóng góp 7 kiến tạo.[9] Anh là hậu vệ có số kiến tạo cao thứ hai tại Ngoại hạng Anh mùa giải này, chỉ sau người đồng đội Aaron Cresswell.[10]